对于微店的未来，争议一直存在。
看好者如孙涛勇，认为未来微店将占到电商30%—40%的份额。而据第三方电子商务研究机构的数据显示，截至6月底，全国电子商务交易额达5.85万亿元，同比增长34.5%。按此数据以及孙涛勇的判断估算，微店将是一个年交易额超3万亿的巨大市场空间。
而在另外一些人看来，这种判断过于乐观。易观分析师王小星认为，社交与电商的结合能否做好还有待商榷，“腾讯这么多年也没做好”，虽然Facebook在广告对电商的引流做得比较好，但中国与美国的消费习惯很不一样，“在我们的研究中，发现微信对电商的引流非常有限，包括微博此前对电商的引流也非常有限。”
对于微店存在的问题，王小星向网易科技表示，目前微店的状态就像早期阶段的淘宝，产品同质化情况极其严重。
孙涛勇在接受网易科技的采访中也表达了相似的观点。他认为，目前开设微店的大多是个人小卖家，因此除了产品同质化严重之外，在商品质量上也无法把控，“当高品质企业进入微商，就会出现微店小卖家被洗牌。”
此外，微店生态还严重缺乏信用体系和维权机制，这也是微店做大、成为下一个淘宝必须迈过的坎。
目前，即使是入驻微商最多的口袋购物“微店”，也还没有建立类似于传统电商的信用成长体系，入驻的微商也没有向平台交纳任何保证金。王珂称，微店此前“熟人交易”比较多，“信用”多来自社交关系中的“信任”，目前微店已经上线了“店铺分级”系统，“期待通过社交关系来建立一种新的评价机制。”
微商哈爸则表示，并不在乎微店是否建立信用体系，因为他的用户大多来自他的粉丝，这是一种信任。
但孙涛勇认为，这种信任是比较薄弱的，一旦出现问题，消费者的维权很难得到申诉。拍拍方面也表示，目前流行的朋友圈电商对社交环境造成了骚扰，还带来欺诈和交易风险，拍拍计划通过支付担保的模式来确保消费者的权益。
微店，急需在这个松散的生态系统上建立一个可控的商业规则。